El INCIBE mx reconoce la importancia de formar centros de desarrollo multidisciplinario, cuyos expertos fortalezcan el aprendizaje, capacitación, actualización, difusión y certificación de los miembros que integran al Instituto. Por lo anterior, la Mesa Directiva acordó crear las Comisiones.

Las Comisiones del INCIBE mx tienen como función el generar diálogo en sectores que son trascendentes para la construcción de una cibersociedad más segura. Éstas dependen de la Mesa Directiva, sin embargo, cuentan con autonomía suficiente buscar proyectos que, dentro de sus funciones, permitan que el INCIBE mx sea un organismo eficiente, eficaz, responsable, social y tecnológicamente apto para enfrentar los riesgos de seguridad informática.